1986 yılında açılmış olan Fatih İlkokulu, 1987 yılında açılmış Fatih Ortaokulu müstakil olarak eğitim-öğretim faaliyetlerini başarıyla sürdürmüş, ilerleyen süreçte Milli Eğitim Bakanlığının onayı ile 1991-1992 öğretim yılı başında her iki okul birleştirilerek İlköğretim okuluna dönüştürülüp adı da Fatih İlköğretim Okulu olarak onaylanmıştır.

2012-2013 Öğretim Yılında İmam Hatip Ortaokuluna dönüştürülen okulumuz Fatih İmam Hatip Ortaokulu adını almış; 6 şubede 232 öğrenci ile öğrenime başlamıştır. 

2013-2014 Eğitim –Öğretim Yılında Beylikbağı Ortaokulu-İlkokulu binasında Eğitim-Öğretim faaliyetlerini sürdüren okulumuz 2014-2015 Eğitim öğretim yılı itibariyle yeni binamızda 750 öğrenci ile normal eğitim faaliyetine başlamış, 2015-2016 Öğretim yılında kayıt için müracaatın çok olması sebebiyle ikili eğitime geçmiştir. 

2019- 2020 Eğitim-Öğretim yılı itibari ile okulumuz 903 öğrencisi ile ikili eğitime devam etmektedir. 

2025 -2026 Eğitim-Öğretim yılı itibari ile okulumuz 502 öğrencisi ile tam gün eğitime devam etmektedir.